深港西部通道是国家重点工程和大型跨界工程，主体工程包括深圳湾口岸和大桥，总投资160亿元，2007年7月1日通车，胡锦涛总书记和香港特首曾荫权参加了口岸通车典礼。深港西部通道口岸设计通过能力5.86万辆/日，在国内首次采用“一地两检”模式，是世界上规模最大、设施最先进的现代化、智能型公路口岸。
 
我院参加了西部通道的工程可行性研究，负责桥位论证和口岸研究。承担“一地两检”口岸的总体设计，针对口岸内部交通量大、功能模块多、清关车辆查验和作业种类多、交通组织复杂等情况，进行了各种交通量和不同作业模式下的三维交通仿真研究和设计，以优化口岸交通组织和总体布置；承担香港和深圳口岸的工程设计，专业涵盖交通工程、道路桥梁、建筑结构、给排水、电力通信、弱电和智能化系统等。香港口岸严格按照英国B.S.技术标准进行工程设计，我院对相关的内地标准和英国 B.S标准的差异进行了系统研究并应用于设计中。
 
深港西部通道口岸工程规划和设计过程中开展了一系列的专题研究，主要有：
 
【专题研究一】一国两制背景下的一地两检体系研究
本课题以深港西部通道为依托，通过与工程设计的互动研究，解决了创新模式下的口岸监管方式、涉及两地的工程技术标准和工程建设模式。研究首次提出的“一地两检”模式突破了两地不同体制下行政、司法层面的障碍，由技术创新推动了制度的突破。
 
【专题研究二】大型公路口岸布设关键技术研究
 针对当前大型公路口岸布置设计缺乏理论支持、以经验判断为主等问题，结合西部通道口岸的实际，通过对国内外主要的公路口岸历史、现状及发展趋势进行了系统的研究和预测，提出了大型公路口岸布设的关键技术，完善了公路口岸类的规划设计理论，并直接应用于深港口岸一体化设计中。
 
【专题研究三】深港西部通道口岸路面设计研究
 通过对特重交通条件下的填海口岸场地及道路路面设计与施工工艺研究，探索填海区在重载、低速、起停频繁条件下大面积场地及道路结构设计与施工的关键技术，以指导口岸道路工程的设计和施工，提高了工程质量、可靠度和使用寿命，并为我国今后建设类似工程和制定相关技术标准提供参考。